Obsługa projektów PO WER odbywa się przez system SOWA. Obecnie została udostępniona nowa wersja systemu SOWA, oznaczona numerem 5.0.
W ramach aktualizacji systemu dodano nowe funkcjonalności, m.in. wprowadzono usługę newslettera, w module korespondencji dodano oznaczenia liczby nieprzeczytanych wiadomości oraz usprawniono działanie filtrów.
Nowa wersja znajduje się na stronie https://www.sowa.efs.gov.pl w zakładce Pomoc.